ORGANIZACIÓN
DESPACHO SUPERIOR
- Secretaría General
- Dirección de Educación Comunitaria y Padres de Familia
- Comisión Coordinadora de Educación Nacional
- Dirección Nacional de Asesoría Legal
- Dirección de Comunicación y Relaciones Públicas
- Oficina de Cooperación Internacional
- Dirección de Equiparación de Oportunidades
- Consejo Permanente Multisectorial para Implementación del Compromiso Nacional por la Educación (COPEME)
- Dirección de Auditoría Interna
- Oficina del Fondo de Equidad y Calidad de la Educación (FECE)
- Dirección Nacional de Enseñanza de Lengua Extranjera
- Dirección de Planificación
- Oficina de Estadística
VICEMINISTERIO ACADÉMICO
- Dirección Nacional de Evaluación Educativa
- Dirección Nacional de Formación y Perfeccionamiento Profesional
- Dirección Nacional de Currículo y Tecnología Educativa
- Dirección General de Educación
- Dirección Nacional de Educación Inicial
- Dirección Nacional de Educación Básica General
- Dirección Nacional de Educación Media Académica
- Dirección Nacional de Educación Media Profesional y Técnica
- Dirección Nacional de Educación de Jóvenes y Adultos
- Dirección Nacional de Educación Particular
- Dirección Nacional de Coordinación Tercer Nivel Enseñanza Superior
- Dirección Nacional de Educación Especial
- Dirección Nacional de Orientación Educativa y Profesional
- Dirección Nacional de Servicios Psicoeducativos
- Dirección Nacional de Educación Intercultural Bilingüe
- Dirección Nacional de Educación Ambiental
- Dirección Nacional de Asuntos Estudiantiles
- Centro de Arte y Cultura
VICEMINISTERIO ADMINISTRATIVO
VICEMINISTERIO DE INFRAESTRUCTURA
INSTITUCIONES DEL SECTOR EDUCATIVO Y DE LA SOCIEDAD CIVIL VINCULADAS A LA EDUCACIÓN
- IFARHU (Instituto para la Formación y Aprovechamiento de Recursos Humanos).
- INADEH (Instituto Nacional de Formación Profesional y Capacitación para el Desarrollo Humano).
- IPHE (Instituto Panameño de Habilitación Especial)
- CONEAUPA (Consejo Nacional de Evaluación y Acreditación Universitaria de Panamá)
- CTDA (Comisión Técnica de Desarrollo Académico)
- Ministerio de Cultura.
- Pandeportes (Instituto Panameño de Deportes)